Kinderen met cystische fibrose (CF, taaislijmziekte) hebben een andere darmmicrobiota dan gezonde kinderen. Ze hebben een kleiner soortenaantal aan bacteriën en andere, minder interessante bacteriesoorten zijn dominant. Hoe armer de soortenrijkdom, hoe groter de kans op woekeringen van ongunstige bacteriën en het optreden van ontstekingen. CF-patiënten moeten vaak antibiotica nemen, die verergeren het probleem van bacteriële woekeringen.