In recent onderzoek is een verband aangetoond tussen de microbiota-samenstelling van kinderen die via een keizersnede geboren worden en de kans op luchtweginfecties in het eerste levensjaar. Uit eerder onderzoek komt naar voren dat baby’s die met een keizersnede geboren zijn een darmmicrobiota ontwikkelen met de kenmerken van een volwassen huid en van de ziekenhuisomgeving, wat ze vatbaarder maakt voor opportunistische pathogenen. Deze resultaten zijn mogelijk mede beïnvloed door antibioticagebruik van de moeder tijdens de bevalling.